O excesso de matéria orgânica pode deteriorar a qualidade da água do charco e promover a libertação de metano. É necessário a remoção de matéria orgânica em decomposição fora da época de reprodução, por exemplo no pico do verão e no pico do inverno. Nunca retirar todas as folhas de uma só vez e verificar a presença de espécies nos sedimentos retirados.
Controlo da vegetação
Vegetação em excesso pode ser prejudicial para o charco, diminuindo a sua exposição solar. Por noma, as plantas ocupam cerca de 30% da massa de água. Esteja atento às espécies que se reproduzem rapidamente e faça uma gestão sempre que necessário.
Erradicação de espécies invasoras
Atuar sempre na prevenção de espécies invasoras, de forma a não desequilibrar o ecossistema do charco. Sempre que for detetada uma planta invasora retirar assim que possível.
Acessibilidade da fauna
Diminuir os declives acentuados nas massas de água, como tanques, através da criação de rampas de acesso. Isto poderá ser facilmente feito com o empilhamento de pedras dentro e fora da massa de água.